Beethoven családja, George és Alice Newton, a 15 éves Ryce, a 11 éves Ted és a 6 éves Emily elfoglaltabb, mint valaha. Beethoven magányosan őgyeleg a ház körül. Aztán egy parkban megpillantja Missyt, a legszebb bernáthegyi lányt a világon. Egy pillantás – és Beethoven elveszett… 10 hét múlva a gyerekeknek feltűnik, hogy Beethoven furcsán viselkedik. Egyre többet csatangol el a háztól. Hamar kiderül, hogy Beethoven családot alapított. A gyerekek a 4 kölyökkutyát becsempészik a házba és megpróbálják titokban tartani. De eljön az idő, amikor a ház ura George Newton rájön az igazságra.