A haditengerészet kötelékébe tartozó két búvár, Tom Franklin és Jim Porter véletlenül felfedezi a tenger mélyén rejtőzködő Nautilust. Ahogy belesnek a tengeralattjáró egyik ablakán, megpillantják a korabeli tengerészöltözetben lévő Nemo kapitányt, aki rábeszéli őket, hogy tartsanak vele megkeresni Atlantiszt. Hármasban neki is vágnak a kalandos útnak, ám útközben találkoznak Waldo Cunningham professzor robotokkal felszerelt járművével, a Ravennel. A professzor megzsarolta Washingtont, hogyha nem fizetnek neki dollármilliókat, eltünteti a várost a Föld felszínéről. Nemo kapitány a város megmentésére siet, majd párbajban legyőzi Cunningham egyik bérencét is. Végül Franklinnel és Porterrel ismét elindulnak Atlantisz felé…